Факт обогащенности аквагенного (сапропелевого) органического вещества (ОВ) изотопом ¹²C по сравнению с террагенным (гумусовым) объясняется полимерлипидной природой первого, которая формируется в диагенезе. Показано разнонаправленное влияние превращений ОВ в диагенезе на изотопный состав. В катагенезе изотопный состав углерода ОВ практически не меняется, в апокатагенезе и метагенезе происходит накопление в ОВ изотопа ¹³C. На примере образцов, претерпевших умеренный катагенез, показана стабильность изотопного состава фоссилизированного аквагенного ОВ с рифея, а террагенного с верхнего палеозоя до четвертичного периода. Увеличение относительной роли изотопа ¹³C в ОВ в верхнепалеозойских и более молодых отложениях по сравнению с докембрийскими и нижне-среднепалеозойскими связано с преобладанием в первых террагенного ОВ.