В работе проведено сопоставление гидрогеохимических условий юрско-меловых отложений Колтогорско-Толькинской шовной зоны и прилегающих тектонических структур первого порядка на основе результатов анализа химического состава почти 1500 проб подземных вод. Выполнено сравнение средних значений общей минерализации подземных вод и содержания в них основных компонентов ионно-солевого и микрокомпонентного состава по апт-альб-сеноманскому, неокомскому и юрскому водоносным комплексам Колтогорского и Толькинского мегапрогибов, Южно-Толькинского прогиба, Тагринского, Бахиловского, Александровского и Средневасюганского мегавалов, а также Нижневартовского и Каймысовского сводов. С использованием классификации В. А. Сулина и кластерного анализа охарактеризован тип подземных вод по комплексу гидрогеохимических показателей. Установлено, что наличие шовной зоны не находит прямого отражения в гидрогеохимических условиях глубоких горизонтов этой зоны и сопредельных районов.