На основании исследования газово-жидких включений в кварце, сфалерите и карбонате выявлено, что колчеданно-полиметаллическое месторождение Чекмарь сформировано при 120-380°С восходящими гидротермальными растворами с постепенным их охлаждением при движении. Тело кварцитов, вмещающее Главную рудную залежь, образовано так же гидротермальными растворами на близповерхностном уровне, о чем свидетельствует высокое значение температурного градиента.