В статье представлены результаты тематического анализа российских журналов из перечня рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук, утвержденного Высшей аттестационной комиссией (далее - Перечень ВАК), учредителями которых являются федеральные, национальные исследовательские университеты и опорные вузы. Распределение журналов по областям знаний проведено на основе Государственного рубрикатора научно-технической информации (ГРНТИ). Выполнен анализ тематических классов журналов в зависимости от типа университета-учредителя, и проведено сравнение с общероссийским тематическим распределением изданий Перечня ВАК. Для анализа научных направлений, наиболее полно представленных российскими университетскими журналами на международном уровне, использована классификация Scopus - All Science Journal Classification (ASJC). По базе данных "Российский индекс научного цитирования" (РИНЦ) продемонстрировано общее доминирование университетских журналов по социальным и гуманитарным наукам, значительная часть таких журналов включена также в Scopus. Достаточно полно в РИНЦ и в Scopus представлены университетские журналы по отдельным направлениям естественных и точных наук. Международному сообществу слабо видны университетские журналы по наукам о жизни, в Scopus почти не представлены университетские издания по медицине и здравоохранению, так как журналы данной тематики издаются, в основном, российскими коммерческими издательствами и научными центрами. Подробный анализ результатов на уровне отдельных университетов и изданий может быть полезен учредителям и редакторам журналов при решении вопросов о корректировке тематики и возможном открытии новых наименований.