Цагансубургинское медно-молибденовое месторождение приурочено к СЗ части Цагансубургинской горст-антиклинали, являющейся составной частью Восточно-Гобийской депрессии. В пределах рудного поля месторождения наиболее ярко проявлена трещинная тектоника, определяющая распределение и локализацию медно-молибденового оруденения. Основным рудолокализующим и рудоконтролирующим элементом в структуре рудного поля являются нарушения СВ направления, развитые в эндоконтактовой зоне Цагансубургинского сиенито-диоритового массива