На месте современного Восточного Верхоянья в палеозое существовал развивавшийся унаследованно от докембрия прогиб, в котором отсутствовали предгорные и геосинклинальные формации, крупные угловые несогласия и значительный магматизм. Прогиб рассматривается как платформенная структура типа авлакогена
