Основное направление работ лаборатории геохимии нефти и газа - изучение нефтематеринских пород методами органической геохимии с целью оценки перспектив нефтегазоносности осадочных отложений, а также познания закономерностей процесса нафтидогенеза. Коллектив геохимиков института является лидером в этом направлении среди российских исследователей. Изучение геолого-геохимических условий формирования месторождений углеводородов (УВ) играет большую роль в теоретической и прикладной геологии нефти и газа. Понимание механизмов формирования скоплений УВ необходимо для создания методик оценки их локализации в различных геологических объектах и правильной интерпретации результатов прогноза.
В лаборатории накоплен уникальный материал по геологическому строению, органической геохимии и нефтегазоносности осадочных отложений Сибири. Создан банк данных по физико-химическим свойствам нефтей и бензинов некоторых районов Сибири. Собраны и систематизированы данные по составу керогенов и катагенезу рассеянного органического вещества (РОВ) для отдельных стратиграфических горизонтов мезозойских, палеозойских и докембрийских осадочных толщ. Для выявления генезиса, условий диагенеза и катагенеза нафтидов и РОВ обобщены и систематизированы геохимические данные по основным нефтематеринским толщам Сибири. Сравнительный анализ геохимии РОВ и нафтидов (распределение и типы ОВ, катагенез, геохимия углеводородов С5–С8 и УВ–биомаркеров, гетероциклических соединений), позволяет уточнить особенности палеогеографических обстановок осадконакопления; установить начальный и реализованный генерационный потенциал РОВ мезозойских, палеозойских и докембрийских толщ; глубинные пределы вероятной нефтегазоносности; выделить основные очаги нефтегазообразования; выполнить анализ закономерностей размещения залежей УВ; дать прогноз перспектив нефтегазоносности изучаемых отложений; детализировать осадочно-миграционную теорию происхождения нефти.